作为螺杆泵，它所输送的介质在泵中还起对转子的冷却及润滑作用，因此是不允许空转的，否则会因磨擦和发热损坏定子及转子。在螺杆泵初次使用之前应向泵的吸入端注入流体介质或者润滑液，如甘油的水溶液或者稀释的水玻璃、洗涤剂等等，以防初期启动时泵处于磨擦状态。

在污水处理行业有时会发生污泥或者浮渣中的大块杂质(如包装袋等)将吸入管道堵塞的情况，应昼避免这各种现象的出现。如不慎发生此类情况应立即停泵清理，以保护泵的的安全运行。

螺杆泵和电机安装的轴度准确与否，是泵是否平衡运转的首要条件。虽然泵在出厂前均经过准确的调定，但底座安装固定不当会导致底座扭曲，引起同轴度的超差。因此在初次运转前，或在大修后应校验其同轴度。
 

在运行过程中，螺杆泵基座螺栓的松动会造成机体的振动、泵体移动、管线破裂等现象。因此对基座螺栓的经常紧固是十分必要的，对泵体上各处的螺栓也应如此。在工作中应经常检查电机与减速机之间、减速机与吸入腔之间以及吸入腔与定子之间的螺栓是否牢固。

尽管这些螺栓有各种防松措施，但由于处在运行中震动较大，仍可能有一此螺栓发生松动，一旦万向节或挠性轴脱开，将使螺杆泵造成进一步的损坏，因此每运转300～500h，应打开泵对此处的螺栓进行检查、紧固，并清理万向节或者挠性轴上的缠绕物。